随着医学科学水平的提升，各科室的手术更加迈向更高端、更精准的方向发展，现如今的的医院手术部，洁净手术室按科室手术无菌风险控制要求，分为4个等级， 洁净手术室按洁净卫生程度从高到低分，为Ⅰ级手术室、Ⅱ级手术室、Ⅲ级手术室、Ⅳ级手术室。在以往的设计图纸中也会有相应的等级标识，对应的空气洁净度等级分别如下：
特别洁净手术室，适用于心脏手术、人工关节置换、器官移植等无菌手术。百级无尘车间0.5微米的容许粒子浓度小于3520(pc/m3)，5微米的容许粒子浓度小于293(pc/m3)。
手术区100级
周边区1000级
Ⅱ级，适用于骨科、脑外科、整形外科、普通外科中的1类手术。
标准洁净手术室
手术区1000级
周边区10000级
Ⅲ级，适用于胸外科、泌尿外科、妇产科、普通外科（除1类切口）手术。
一般洁净手术室
手术区10000级
周边区100000级
Ⅳ级，感染手术、胃肠道手术、急诊手术。
准洁净手术室
手术区和周边区300000级
层流手术室是采用空气洁净技术对微生物污染源采取程度不同的控制，以达到被控制空间环境内空气洁净度适于各类手术之要求；并提供适宜的温度、湿度，创造一个清新、洁净、舒适、细菌数低的手术空间环境，使患者在手术时组织受到尽可能少的损伤，并大大降低患者和医护人员的二次感染率，尤其是颅内手术和烧伤手术，保证患者术后能更快更好地恢复等
计算方式：
层流手术室的空气压力根据其不同区域（如手术间、无菌准备间、刷手间、麻醉间和周围干净区域等）洁净度不同要求而不同。不同级别的层流手术室其空气洁净度标准不同，例如美国联邦标准1000级为每立方尺空气中≥0.5μm的尘粒数，≤1000颗或每升空气中≤35颗。10000级层流手术室的标准为每立方尺空气中≥0.5μm的尘粒数≤10000颗或每升空气中≤350颗。依次类推。